1974 yılında İstanbul Üniversitesi Edirne Tıp Fakültesi kurulmuş, 1976 yılında Edirne’de Fakülte binalarının temeli atılmıştır. 1974-1975 akademik yılında ilk öğrencilerini alarak, 1982 yılına kadar İstanbul Üniversitesi Edirne Tıp Fakültesi olarak Cerrahpaşa Tıp Fakültesi bünyesinde İstanbul’da faaliyet göstermiştir. 1982 yılında 41 Sayılı Kanun Hükmünde Kararname ile kurulan Trakya Üniversitesi’ne bağlanmış ve aynı yıl 20 öğretim üyesi ve az sayıda idari personeli ile Edirne’ye taşınmıştır.
2015 yılı itibariyle Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi olarak 30 yıllık bir geçmişe sahip olan Fakülte bu süreçte akademik kadrosunu 106 profesör, 44 doçent, 48 yardımcı doçent,315 araştırma, 1 öğretim görevlisi olmak üzere zenginleştirmiş, bilimsel yayın sayısını artırmış, öğrenci eğitimi için gerekli donanımlarını tamamlamış, tıbbın hemen bütün ana dallarında sağlık hizmeti verir konuma gelmiş, hasta yatak kapasitesini kuruluşundan bu yana 50 den 1050'ye çıkarmıştır. Göz hastalıklarında lazer; nükleer tıpta gama-kamera; radyodiagnostikte BT ve MR ile acil servise ikinci bir BT; iç hastalıklarında endoskopi, dializ ünitesi; kardiyolojide anjiografi ve cerrahi branşlarda laparoskopik cerrahiyi kurarak tüm Trakya Bölgesine modern teknoloji ile sağlık hizmetleri sunmayı amaçlamıştır.
1998 yılı sonunda Kalp ve Damar Cerrahisi faaliyete geçmiş ve açık kalp ameliyatları başlamıştır. Radyasyon Onkolojisi Anabilim Dalı ise Cobalt-60 teleterapi ünitesi ve tedavi planlama simülatörü ile 1999 yılı sonunda faaliyete geçmiştir. 2010 yılında Böbrek Nakli Merkezi kurulmuş; 2012 yılında da Balkan Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Hastanesi ve Balkan Onkoloji Hastanesi açılmıştır. Tüp Bebek Merkezi 2013 yılında faaliyete geçmiştir. Toplam 42 Anabilim Dalı ve 27 Bilim Dalı faaliyettedir. Üniversitemiz, bölgesel anlamda sadece Türkiye'ye değil, Tüm Balkanlara hizmet vermekte olup Balkan Coğrafyasının en kapsamlı hastanesidir.
2015 yılında hizmete açılan yeni, modern, kapsamlı ve tam donanımlı eğitim öğretim binasıyla Türkiye'nin en gelişmiş Tıp Fakültesi amfilerine sahiptir.
Binamızda 270 kişilik 3 amfimiz ve 210 kişilik küçük bir amfimiz olmak üzere 4 amfi bulunmaktadır. Bunun dışında tam donanımlı bir ıslak bir kuru laboratuvar ve bir anatomi diseksiyon salonu da binada bulunmaktadır.