Gıda mühendislerinin tercih ettiği departmanlar öncelikle Ar-Ge ve üretim mühendisliği olsa da, insan kaynakları, pazarlama, finans gibi farklı alanlarda da ilgi duydukları takdirde bu departmanlarda çalışabilirler. Ayrıca, bu departmanlardaki insanlara sorularını yöneltebilirler. Bunun dışında, Ar-Ge ve üretim departmanlarını tercih ederek bu alanlarda çalışma imkânı da yakalayabilirler.